强磁水处理器对流体的作用是多方面的，其原理是使水以一定的流速切割磁力线的方式对水进行处理，通过磁场的作用降低了水的表面张力，增加水中离子的电导率，缓冲PH值使之趋向于中性等等。 水的导体，当水流经于一个适当聚集的磁场时，将产生一个电动势，这个电动势将使水带上直流正电荷而互相排斥、分离，这导致水的表面张力大大降低，从而使水具有溶解性，这样水能溶解更多的可溶解物质，起防垢作用：水溶解性的加大也使水能溶解那些已结的水垢，起除垢作用。     由于磁场作用，水感应出正电荷，将水中过剩的氢离子和氢根离子束缚起来，减少PH值的波动，杜绝了电解腐蚀：负电性的管道形成阴极性保护，也由有效的防止管道腐蚀。在外超磁场的作用下，水作用为电解质，在水中形成电流，由于电流的存在使活性氧增加，使细胞壁变薄，细胞液流失，破坏了水中的细菌、藻类微生物赖以生存的电磁环境而导致细菌和藻类的死亡，达到了杀菌灭藻的功能。     20000高斯以上至40000高斯的强磁水处理器安装在钢（铁）管外部时，超强的磁力线穿透管壁与管内流动的液体相切割产生电流（法拉第原理），使管路及设备带负电而排斥带负电的离子，如碳酸根CO32－、氧O2－、菌类接触管壁，同时使水离子化（H2O→H++OH－），离子化水中的H＋被带负电的管壁吸引，将已存在管壁上的硬垢溶解成松散的软垢，直至剥落下来，离子化水能降低水表面张力，从而加快水中杂质沉淀。